Socióloga y doctora en Políticas Públicas en Ciencia y Tecnología (Georgia Institute of Technology, 2007), en las dos últimas décadas Bortagaray ha trabajado en el área de los estudios de las políticas públicas de ciencia, tecnología e innovación. Es profesora adjunta (DT) del Instituto de Desarrollo Sostenible, Innovación e Inclusión Social, Sede Tacuarembó, CENUR Noreste, UdelaR. Integra el Sistema Nacional de Investigadores, Nivel I y desde 2017 integra el CONICYT como representante de la Universidad de la República.
En los últimos años su trabajo académico se ha volcado al análisis de las políticas de ciencia, tecnología e innovación (CTI) como instrumentos de desarrollo sustentable e inclusivo. Esta preocupación por la dirección de las políticas de CTI hacia un desarrollo sustentable e inclusivo tiene como una de sus manifestaciones lo que ocurre a nivel más micro, considerando el rol específico de los distintos actores en los procesos de producción y uso de conocimiento, y en la toma de decisiones. En este sentido, durante los últimos años ha explorado el análisis de la producción de conocimiento e innovación contemplando no sólo los actores más tradicionales como son la comunidad académica, el sector productivo empresarial o los actores gubernamentales, sino también la sociedad civil, como un pilar fundamental de estos procesos. Sus últimos proyectos de investigación involucran a la sociedad civil, tanto para avanzar en la comprensión de problemas vinculados a la sustentabilidad, por ejemplo en torno al uso y gestión de recursos naturales como el agua, o en relación a la evaluación de modelos de desarrollo desde la perspectiva de las propias comunidades y sectores afectados por cambios productivos. Tiene a su cargo proyectos de investigación sobre estas temáticas, así como produccion cientifica en revistas internacionales especializadas. Actualmente, junto a Amalia Stuhldreher (IDIIS, UDELAR) co-coordina el proyecto I+D (CSIC) “¿Es la bioeconomía una estrategia plausible de desarrollo humano sustentable para el noreste de Uruguay? Discusión teórico-conceptual y bases empíricas para su implementación”, y junto a Carlos Bianchi el proyecto “Corredor norte-centro-sur de aceleración de conocimiento. Caracterización y análisis desde la perspectiva del desarrollo sostenible”, con financiación PNUD.